依据《企业所得税法》规定，企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。

该赔偿金的支出如果是与企业生产经营有关的，可以在企业所得税税前扣除。法院判决企业支付赔偿金，因为没有发生应税行为，所以无法开具发票，企业可凭法院的判决文书与收款方开具的收据作为扣除凭据。民事赔偿的可以税前扣除，如果是赔偿款就是营业外支出，如果是诉讼费就放在管理费用。

综上所述， 公司支付的赔偿金是可以税前扣除的。

如果是支付的经济合同违约金是否可以税前扣除?

根据国税发[2000]84号《企业所得税税前扣除办法》第56条规定，纳税人按照经济合同规定支付的违约金可以税前扣除。

其前提条件必须是订立合同的双方在经济合同中明确签订违约的条款，并按《企业所得税扣除办法》的有关规定提供适当的凭据，方可准予税前扣除。

适当凭据具体包括：经济合同、支付违约金的有关协议、支付违约金的银行结算凭证等。

以现金形式支付的违约金原则上不得作为适当的凭据。

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